Anomalia di funzionamento del sistema immunitario che scatena una reazione contro alcuni dei propri componenti. Nel proprio sviluppo, il sistema immunitario è in grado di distinguere ciò che gli appartiene (gli antigeni self) da ciò che è estraneo (ovvero non self). Nel caso dell’autoimmunità, il sistema immunitario non riconosce come self e dunque come innocui, alcuni propri elementi costituenti e reagisce contro l’organismo stesso.
Il fenomeno è alla base delle cosiddette malattie autoimmuni, come artrite reumatoide, lupus eritematoso sistemico, sclerosi multipla.